Evidence for the role of the oxygen-evolving manganese complex in photoinhibition of Photosystem II

AbstractPhotoinhibition of PSII occurs at the same quantum efficiency from very low to very high light, which raises a question about how important is the rate of photosynthetic electron transfer in photoinhibition. We modulated electron transfer rate and light intensity independently of each other in lincomycin-treated pea leaves and in isolated thylakoids, in order to elucidate the specific effects of light and PSII electron transport on photoinhibition. Major changes in the rate of electron transport caused only small changes in the rate of photoinhibition, suggesting the existence of a significant photoinhibitory pathway that contains an electron-transfer-independent phase. We compared the action spectrum of photoinhibition with absorption spectra of PSII components that could function as photoreceptors of the electron-transfer-independent phase of photoinhibition and found that the absorption spectra of Mn(III) and Mn(IV) compounds resemble the action spectrum of photoinhibition, showing a steep decrease from UV-C to blue light and a low visible-light tail. Our results show that the release of a Mn ion to the thylakoid lumen is the earliest detectable step of both UV- and visible-light-induced photoinhibition. After Mn release from the oxygen-evolving complex, oxidative damage to the PSII reaction center occurs because the Mn-depleted oxygen-evolving complex cannot reduce P680+ normally

Sähkön jakeluverkon luvitusmenettelyjen sujuvoittaminen

Vuonna 2013 voimaan tullut sähkömarkkinalaki 588/2013 edellyttää sähkönjakeluverkkojen toimitusvarmuuden parantamista, mikä edelleen edellyttää investointeja nykyiseen sähköverkkoon. Nämä investointihankkeet vaativat toteutuakseen useita lupa- ja lausuntomenettelyjä. Vaadittujen lupa- ja muiden rakentamista edeltävien menettelyjen on käytännössä todettu vievän niin paljon aikaa, että ne hidastavat toimitusvarmuusvaatimusten toteutumista sekä aiheuttavat korkeita kustannuksia. Tämän selvityksen tavoitteena on ollut löytää kustannustehokkaita keinoja lakisääteisen sähkön toimitusvarmuuden parantamiselle sujuvamman sähkön jakeluverkon luvituksen myötä. Jakeluverkkoinvestointien luvitus on tapauskohtaisesti vaihdellen useista eri lupa-, lausunto- ja muista menettelyistä koostuva kokonaisuus. Selvityksessä havaitut luvituksen haasteet ovat moninaisia eivätkä kaikki suoraan viranomaismenettelyihin liittyviä. Kolme todettua keskeistä osa-aluetta luvituksen sujuvoittamiseksi ovat maanomistajat ja heidän kanssaan tehtäviin sopimuksiin liittyvä vuorovaikutus, lupamenettelyjen sähköinen asiointi sekä kunnallisten lupamenettelyjen yhdenmukaistaminen. Kuhunkin osa-alueeseen on annettu useita konkreettisia ehdotuksia sujuvoittamista koskien. Sähkön jakeluverkon luvituskokonaisuuden kehittämisestä vastaava tahoa ei tällä hetkellä ole ja erillisiä lupamenettelyjä kehitetään huomioimatta välttämättä luvituksen kokonaiskuvaa. Tässä selvityksessä on ehdotettu kokonaisuuden kehittämiseen eri viranomaistahoista koostuvaa yhteistyöryhmää, joka tarkastelisi jakeluverkkojen luvituksen kokonaisprosessia ja osaltaan seuraisi ja tukisi eri ministeriöiden jakeluverkkojen luvitukseen liittyviä muita selvityksiä ja sujuvoittamishankkeita

Turku Centre for Computer Science – Annual Report 2013

Due to a major reform of organization and responsibilities of TUCS, its role, activities, and even structures have been under reconsideration in 2013. The traditional pillar of collaboration at TUCS, doctoral training, was reorganized due to changes at both universities according to the renewed national system for doctoral education. Computer Science and Engineering and Information Systems Science are now accompanied by Mathematics and Statistics in newly established doctoral programs at both University of Turku and &Aring;bo Akademi University. Moreover, both universities granted sufficient resources to their respective programmes for doctoral training in these fields, so that joint activities at TUCS can continue. The outcome of this reorganization has the potential of proving out to be a success in terms of scientific profile as well as the quality and quantity of scientific and educational results.&nbsp; International activities that have been characteristic to TUCS since its inception continue strong. TUCS&rsquo; participation in European collaboration through EIT ICT Labs Master&rsquo;s and Doctoral School is now more active than ever. The new double degree programs at MSc and PhD level between University of Turku and Fudan University in Shaghai, P.R.China were succesfully set up and are&nbsp; now running for their first year. The joint students will add to the already international athmosphere of the ICT House.&nbsp; The four new thematic reseach programmes set up acccording to the decision by the TUCS Board have now established themselves, and a number of events and other activities saw the light in 2013. The TUCS Distinguished Lecture Series managed to gather a large audience with its several prominent speakers. The development of these and other research centre activities continue, and&nbsp; new practices and structures will be initiated to support the tradition of close academic collaboration.&nbsp; The TUCS&rsquo; slogan Where Academic Tradition Meets the Exciting Future has proven true throughout these changes. Despite of the dark clouds on the national and European economic sky, science and higher education in the field have managed to retain all the key ingredients for success. Indeed, the future of ICT and Mathematics in Turku seems exciting.</p

Constellations of Correspondence : a Linked Data Service and Portal for Studying Large and Small Networks of Epistolary Exchange in the Grand Duchy of Finland

Peer reviewe

Constellations of Correspondence : a Linked Data Service and Portal for Studying Large and Small Networks of Epistolary Exchange in the Grand Duchy of Finland

Peer reviewe

Common Inflammation-Related Candidate Gene Variants and Acute Kidney Injury in 2647 Critically Ill Finnish Patients

Acute kidney injury (AKI) is a syndrome with high incidence among the critically ill. Because the clinical variables and currently used biomarkers have failed to predict the individual susceptibility to AKI, candidate gene variants for the trait have been studied. Studies about genetic predisposition to AKI have been mainly underpowered and of moderate quality. We report the association study of 27 genetic variants in a cohort of Finnish critically ill patients, focusing on the replication of associations detected with variants in genes related to inflammation, cell survival, or circulation. In this prospective, observational Finnish Acute Kidney Injury (FINNAKI) study, 2647 patients without chronic kidney disease were genotyped. We defined AKI according to Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) criteria. We compared severe AKI (Stages 2 and 3, n = 625) to controls (Stage 0, n = 1582). For genotyping we used iPLEX(TM) Assay (Agena Bioscience). We performed the association analyses with PLINK software, using an additive genetic model in logistic regression. Despite the numerous, although contradictory, studies about association between polymorphisms rs1800629 in TNFA and rs1800896 in IL10 and AKI, we found no association (odds ratios 1.06 (95% CI 0.89-1.28, p = 0.51) and 0.92 (95% CI 0.80-1.05, p = 0.20), respectively). Adjusting for confounders did not change the results. To conclude, we could not confirm the associations reported in previous studies in a cohort of critically ill patients.Peer reviewe

Heme oxygenase-1 repeat polymorphism in septic acute kidney injury

Acute kidney injury (AKI) is a syndrome that frequently affects the critically ill. Recently, an increased number of dinucleotide repeats in the HMOX1 gene were reported to associate with development of AKI in cardiac surgery. We aimed to test the replicability of this finding in a Finnish cohort of critically ill septic patients. This multicenter study was part of the national FINNAKI study. We genotyped 300 patients with severe AKI (KDIGO 2 or 3) and 353 controls without AKI (KDIGO 0) for the guanine-thymine (GTn) repeat in the promoter region of the HMOX1 gene. The allele calling was based on the number of repeats, the cut off being 27 repeats in the S-L (short to long) classification, and 27 and 34 repeats for the S-M-L2 (short to medium to very long) classification. The plasma concentrations of heme oxygenase-1 (HO-1) enzyme were measured on admission. The allele distribution in our patients was similar to that published previously, with peaks at 23 and 30 repeats. The S-allele increases AKI risk. An adjusted OR was 1.30 for each S-allele in an additive genetic model (95% CI 1.01-1.66; p = 0.041). Alleles with a repeat number greater than 34 were significantly associated with lower HO-1 concentration (p<0.001). In septic patients, we report an association between a short repeat in HMOX1 and AKI risk

Tukiviittomat päiväkodin arjen apuvälineenä : tukiviittomakansion koonti ja käyttö

Opinnäytetyömme on toiminnallinen kehittämishanke, jonka tuotos on tukiviittomakansio päiväkodin arjen apuvälineeksi. Idea nousi omista mielenkiinnon kohteistamme ja työelämän tarpeesta. Toimeksiantajamme oli Pilke päiväkodit Oy ja käytännössä kehittämistyö tapahtui Turun alueen kolmessa eri yksikössä. Tavoitteenamme oli kehittää hyödyllinen ja käytännöllinen arjen apuväline, jota päiväkodin henkilökunta pystyy hyödyntämään konkreettisesti lasten kielen kehityksen tukemisessa. Kehittämishankkeemme on ajankohtainen, sillä lasten kielen kehityksen ongelmat ovat yleisiä. Päiväkodin arjessa täytyy huomioida varhaiskasvatuksen lisäksi varhaiserityiskasvatus, lasten kielen kehitys ja siihen liittyvät ongelmat sekä kielen kehityksen tukeminen. Näihin teemoihin perehdyimme opinnäytetyössämme ja niiden pohjalta suunnittelimme ja kokosimme tukiviittomakansion. Tukiviittomat ovat erittäin hyvä menetelmä kielen kehityksen tukemiseen, sillä ne mahdollistavat vuorovaikutuksessa monikanavaisen kommunikoinnin. Tukiviittomakansion kehittämisessä huomioitiin käytännönläheisyys ja kansion teemat nousivat työntekijöiden näkemyksistä ja omista havainnoistamme. Kehittämismenetelminä käytimme päiväkodin arjen havainnointia, vapaamuotoista kyselyä ja lisäksi hyödynsimme teoreettista kirjallisuutta. Valmis kansio otettiin käyttöön kolmessa eri yksikössä ja perehdytimme henkilökunnan sen käyttöön. Lopputuloksena on selkeä ja käytännönläheinen kokonaisuus – tukiviittomakansio päiväkodin arjen apuvälineeksi.Our thesis is a functional development project and its output is the Folder of Supportive Symbols of Sign Language as everyday aid in a kindergarten. The idea of thesis came up from our own interests and needs of everyday life in a kindergarten. The cooperation partner in this Bachelor’s thesis was a private kindergarten Pilke päiväkodit Oy and development project put into practice in three different kindergarten of Turku area. The purpose of development was to make a useful and practical aid of everyday life, which can be used by employees of kindergarten for supporting children language development. The functional development project is topical, because problems of children language development are common. In everyday life in kindergarten, beside of early childhood education, must be noticed early childhood special education, children language development and its problems and also supporting language development. In our Bachelor’s thesis we orientated to these themes and based on them we planned and put together the Folder of Supportive Symbols of Sign Language. The supportive symbols of sign language are a good method of supporting language development, because they make interaction more wide-ranging. In developing the Folder of Supportive Symbols of Sign Language we perceived practicality and the themes of the Folder came from employees’ point of views and our own observations. We used different development methods, for example observation of everyday life in the kindergartens, informal enquiries and also took advantages of theoretical literature. When the Folder was ready, we put it into operation in three different kindergarten and we orientated the employees to use the Folder. The result of our development project is compact and practical output - the Folder of Supportive Symbols of Sign Language as everyday aid in a kindergarten

”On tuhat tapaa lähestyä opittavaa asiaa ja tuhat tapaa oppia se” Eriyttäminen Perusopetuksen opetussuunnitelman perusteissa 1985–2014 ja ensimmäisen luokan matematiikan opettajan oppaissa

Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää, miten eriyttäminen näkyy Perusopetuksen opetussuunnitelman perusteissa 1985–2014 sekä ensimmäisen luokan matematiikan opettajan oppaissa. Tutkitut matematiikan opettajan oppaat olivat Sanoma Pron Kymppi ja Matikka sekä Otavan Tuhattaituri. Perusopetuksen opetussuunnitelmien perusteiden eriyttämiseen liittyvä aineisto analysoitiin aineistolähtöisellä sisällönanalyysilla ja opettajan oppaiden aineisto teorialähtöisellä sisällönanalyysilla. Analyysiyksiköksi valittiin asiakokonaisuus. Tällaisia asiakokonaisuuksia nousi opetussuunnitelmien perusteista esiin 1563. Opetussuunnitelmien perusteiden aineistolähtöisellä sisällönanalyysilla muodostettiin kolme pääluokkaa: 1) opetus, 2) roolit ja arvot sekä 3) tuki. Opettajan oppaiden teorialähtöinen sisällönanalyysi toteutettiin opetussuunnitelmien perusteista nousseiden pääluokkien avulla. Tutkimuksen avulla saatiin selville, että eriyttäminen nousi esiin monipuolisesti perusopetuksen opetussuunnitelmien perusteissa, mutta opetussuunnitelmien perusteiden välillä oli vaihtelua. Kaikissa perusopetuksen opetussuunnitelmien perusteissa voimakkaimmin esiin nousi oppilaan ominaisuuksien huomiointi. Myös myöhemmin julkaistujen erilaisten lisäyksien ja muutosten merkitys nähtiin suurena. Eriyttäminen nousi esiin suhteellisen monipuolisesti myös opettajan oppaissa. Opettajan oppaissa eriyttäminen painottui eritasoisiin tehtäviin ja toisinaan välineiden käyttöön. Arvioinnin monipuolisuus ja opetuksen eriyttämiseen liittyvä opettajan rooli jäivät tutkituissa opettajan oppaissa hyvin vähäisiksi, lähes olemattomiksi.Siirretty Doriast